Agustina Setiawati , M.Sc., Apt - PowerPoint Presentation

Slide1

Agustina Setiawati, M.Sc., Apt

TRANSKRIPSI

Replikasi

Transkripsi

Translasi

Protein

RNA

DNASlide2

REFERENSI/PUSTAKAAlbert, B., Bray, D., Lewis, J., Rarr, M., Roberts, K.

and Watson, J. O., 1994, Molecular Biology of The Cell, 3

rd Ed., Garland Publishing, Inc., New York.Lodish, H., Arnold, B., Zipursky, S. L., Matsudara, P., David, B. and Darnell, J. E., 2000, Molecular Cell Biology, W. H. Freeman and Company, London.Slide3

Double HelixSTRUKTUR DNA

Nitrogenous

Base (A,T,G or C)

“Rungs of ladder”

“Legs of ladder”

Phosphate &

Sugar BackboneSlide4

UNIT FUNGSIONAL DNA/RNASlide5

Perbedaan

struktur

gula antara RNA dan DNASlide6

BASA DNA

PURIN 1.

Adenine (A) 2. Guanine (G)P

IRIMIDIN 3.

Thymine (T) 4.

Cytosine (C)

T or C

A or GSlide7

Chargaff’s Rule

Adenine berpasangan

ThymineGuanine berpasangan

Cytosine

G

C

T

ASlide8

BASE-PAIRINGS

C

G

H-bonds

T

ASlide9

IKATAN RANTAI DNASlide10

IKATAN FOSFODIESTERSlide11

RANTAI

DNA

BERSIFAT ANTIPARALELSlide12

DNA vs. RNADNA

Double HelixGula

deoksiribosaAdenine berpasangan Thymine (A-T)

Tetap ada

di nukleus

RNA

Rantai tunggal

Gula ribosa

Adenin berpasangan Uracil!Ditransport

ke sitoplasmaSlide13

PendahuluanDOGMA SENTRALSlide14

TRANSKRIPSIProses sintesis RNA (mRNA, t-RNA atau r-RNA)Slide15

Table 14.2

Types of RNA

Type of RNAFunctions in

Function

Messenger RNA

(mRNA)

Nucleus,

migrates

to ribosomesin cytoplasm

Carries DNA

sequenceinformation to ribosomes

Transfer RNA(tRNA)

Cytoplasm

Provides linkage

between mRNAand amino acids;

transfers aminoacids to ribosomes

Ribosomal RNA(rRNA)

Cytoplasm

Structural

component

of ribosomesSlide16

Prekursor : ATP CTP GTP UTPMembutuhkan enzim RNA PolimeraseUrutan RNA

ditentukan DNASalah satu

untai DNA sebagai cetakanUntai RNA tumbuh dengan arah

5’-3’Polimerase mulai

sintesis tanpa

primer

TRANSKRIPSI = SINTESIS RNA (mRNA,

tRNA

, rRNA

)

PRINSIP TRANSKRIPSISlide17

Urutan basa RNA ditentukan oleh DNA

GGGAAACCCUUU

RNA

CCCTTTGGGAAA

DNA

TB

Ikatan hidrogenSlide18

gene,or

operon

RNA polymerase

complementary RNA

DNA template

TBSlide19



'

core enzymeTB





'

holoenzyme

POLIMERASE RNA (465.000

kD

)Slide20

a a2 a

2b a2

bb’ = core enzyme

aI

b

b

’

aII

CORE

ENZYME

+

vegetative

(principal

s

)

s

70

SIGMA

SUBUNIT

Langkah

pengabungan

holo enzimSlide21

aI

b

b’

aII

s

70



'

mengikat DNA template



mengikat perkusor RNA (ATP CTP GTP UTP)

 penting untuk penggabungan sub unit dan aktivasi enzim

s

mengenali sekuen promotor pada DNA

Fungsi Sub Unit RNA PolimeraseSlide22

Promotor

Bagian

DNA dimana RNA polimerase menempel

untuk memulai

transkripsi

promoter

Daerah

up stream

Daerah yg

ditranskripsikan

Transkripsi mulai

Daerah terminasi

gene

dsDNA

TB

Daerah

down streamSlide23

Tahap-tahap transkripsiInisiasiElongasi

TerminasiSlide24

Transkripsi pd prokariot - INISIASITdr atas 2 tahap :

Holoenzim mengenal dan menempel pd promoter

spesifikTerbentuk kompleks terbuka & proses inisiasi baru blgs.

Penempelan RNA polimerase pd promoter spesifik

yaitu untai

10 nukleotida pd sisi 5’ (rantai -10,

dikenal sbg Pribnow Box yg

berisi rantai TATAAT & rantai -35

adl TTGACA)Slide25

PREBEDAAN

PROMOTER PROKARIOT & EUKARIOTSlide26
Slide27
Slide28

Perpanjangan rantai RNA

ElongasiSlide29

PERPANJANGAN TRANSKRIPSISlide30

TERMINASI TRANSKRIPSI

Terminator : Daerah pada DNA dapat menyebabkan terjadinya terminasi (akhir transkripsi)

.Terminasi DNA dibedakan menjadi 2, yaitu:1. Terminasi Bebas

2. Terminasi tergantung Faktor

gene dsDNA

region where

terminators are

usually found

termination

site

TB

UUUU

RNASlide31

TERMINASI bebasTerbentuknya

rantai RNA dengan bentuk hair pin (stem

dan loop) yang kaya akan G-C pada stem dan U pada loop.

RNA polymerase

terikat

pada

loopSlide32
Slide33
Slide34

TERMINASI tergantung faktor

Memerlukan protein rho (faktor ρ) dg BM 46000 & bfgs

mbtk heksamer yg menempel pd ss RNA sepanjang 72 pasangan basa (

setiap subunit protein ρ akan menempel pada

12 nukleotida)

Aktivitas ATPase protein ρ akan

memungkinkan protein ρ bergerak sepanjang

hibrid DNA-RNA dg jalan menarik RNA menjauhi

kompleks transkripsi.Slide35
Slide36
Slide37

Monosistronik & polisistronik

Molekul mRNA eukariot tdr

atas rangkaian2 nukleotida yg dpt ditranslasi & tdk dapat ditranslasi. Polipeptida

plg banyak hanya

tdr atas 500

asam amino yg dpt ditranslasi

, dikenal sbg mRNA monosistronik

krn hanya mampu mbtk

tdk lbh dr 1 mcm polipeptida.

Molekul mRNA prokariosit dpt

mentranskripsi lebih dr 1 macam polipeptida, dsbt mRNA

polisistronik. Contoh : mRNA polisistronik E. coli pbtk triptofan dg pjg

7000 rangkaian basa dpt

mbtk 5 mcm enzim.Slide38
Slide39

PolisistronikSlide40

MonosistronikSlide41

DNA

Cytoplasm

Nucleus

Eukaryotic Transcription

Export

G

AAAAAA

RNA

Transcription

Nuclear

pores

G

AAAAAA

RNA

Processing

mRNASlide42

Transkripsi Eukariotik

Butuh faktor transkripsi:

Umum (TFIID, TFIIA, TFIIB, TF IIE, TFIIH, TFIIF)Spesifik: Estrogen—sel payudara Slide43

A “Simple” Eukaryotic Gene

Terminator

Sequence

Promoter/

Control Region

Transcription

Start Site

RNA Transcript

5’ Untranslated Region

3’ Untranslated Region

Exons

Introns

3’

5’

Exon 2

Exon 3

Int. 2

Exon 1

Int. 1

3’

5’

Exon 2

Exon 3

Exon 1

Int. 2

Int. 1Slide44

3’

5’

Exon 2

Exon 3

Int. 2

Exon 1

Int. 1

mRNA maturasi pada Eukariot

Protein Coding Region

3’

Untranslated

Region

5’

Untranslated

Region

3’

AAAAA

3’ Poly A Tail

5’

G

5’ Cap

Exon 2

Exon 3

Exon 1

Int. 2Int. 1

Setelah

selesai

disintesis, mRNA mengalami

proses-proses sebagai

berikut :Capping pada

ujung 5’

Tailing pada ujung 3’

Penghilangan Intron

(Splicing)Slide45

mRNA CappingMelindungi mRNA dari

degradasi eksonuklease 5’-3Inisiasi

transkripsiSlide46

Structure of the 5’ cap

7mG = 7-methyl guanosine

Triphosphate linkage2’ ribose methylationsSlide47

mRNA processingSlide48

Self splicingSlide49

CPSF (cleavage/

polyadenylation specificity factor)

AAAAAAA…..Slide50

SELESAI !!!!